Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM2Q13029 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM2Q13029 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
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