Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMARCB1Q12824 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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