Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms