Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB2Q08289 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms