Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms