Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms