Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSF1Q00613 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms