Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NUP107P57740 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms