Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTBP2P56545 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms