Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA3P52797 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms