Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNQ1P51787 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1P51787 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms