Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms