Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC1A3P43003 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC1A3P43003 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms