Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC112236.1-201ENST00000561977 1098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TEX47-201ENST00000297203 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL135937.1-201ENST00000418690 729 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BX255925.2-201ENST00000605600 515 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL356585.3-201ENST00000625196 1017 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC096543.2-201ENST00000449140 859 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD11P31277 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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