Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD34P28906 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD34P28906 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD34P28906 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms