Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms