Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRDP23468 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRDP23468 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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