Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKACBP22694 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms