Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CREB1P16220 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms