Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRCP08575 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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