Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TYMSP04818 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TYMSP04818 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TYMSP04818 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms