Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL18O94889 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL18O94889 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms