Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCA5O60264 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms