Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA2O43364 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms