Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DFFAO00273 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms