Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L4A6NEF3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms