Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSDA5PKW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms