Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD54BQ9Y620 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms