Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG4BQ9Y4P1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms