Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms