Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTSFQ9UBX1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms