Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DKK2Q9UBU2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms