Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DKK3Q9UBP4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK3Q9UBP4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms