Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RDH8Q9NYR8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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