Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL28Q9NXS3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms