Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO28Q9NVF7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms