Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms