Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2J2Q9GZM3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms