Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms