Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms