Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms