Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms