Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTDSS2Q9BVG9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms