Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERPUD2Q9BSE4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms