Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGIP1Q9BQI5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms