Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRPF18Q99633 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms