Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCNX1Q96RV3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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