Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms