Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK5RAP3Q96JB5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms