Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGF29Q96ES7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms